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New for: D3
What and Who
Design und Implementierung eines hierarchischen Assemblers f"ur das menschliche Genom
Dr. Knut Reinert
Celera Genomics
Informatik-Kolloquium
AG 1, AG 2, AG 3, AG 4
MPI Audience
Note: We use this to send email in the morning.
Date, Time and Location
Friday, 15 September 2000
15:00
-- Not specified --
45 - FB14
HS 001
Saarbrücken
Abstract
Momentan werden zwei unterschiedliche Strategien verfolgt, um das komplette Genom des Menschen zu entschl"usseln. Zum einen der ``BAC-by-BAC''-Ansatz,
welcher vom "offentlichen Humangenomprojekt angewandt wird, zum anderen der ``whole genome shotgun''-Ansatz, der bei Celera Genomics entwickelt wurde.
Beide Projekte schreiten voran und haben bereits erste Resultate erzeugt, eine endg"ultige Version des Genoms ist jedoch noch nicht verf"ugbar. In diesem Vortrag
beschreibe ich das Design und die Implementierung eines ``hierarchischen Assemblers'', welcher Daten von beiden Projekten benutzt und dabei eine Vorabversion
des Genoms erzeugt, welche zu einem gegebenen Zeitpunkt immer besser ist als die separaten Ergebnisse beider Projekte.
welcher vom "offentlichen Humangenomprojekt angewandt wird, zum anderen der ``whole genome shotgun''-Ansatz, der bei Celera Genomics entwickelt wurde.
Beide Projekte schreiten voran und haben bereits erste Resultate erzeugt, eine endg"ultige Version des Genoms ist jedoch noch nicht verf"ugbar. In diesem Vortrag
beschreibe ich das Design und die Implementierung eines ``hierarchischen Assemblers'', welcher Daten von beiden Projekten benutzt und dabei eine Vorabversion
des Genoms erzeugt, welche zu einem gegebenen Zeitpunkt immer besser ist als die separaten Ergebnisse beider Projekte.
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