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What and Who

Ein exakter Algorithmus für das Maximum-Parsimony-Problem

Ernst Althaus
Max-Planck-Institut für Informatik - D 1
Habilitationsvortrag und Kolloquium
AG 1, AG 2, AG 3, AG 4, AG 5, SWS  
AG Audience
German

Date, Time and Location

Monday, 17 July 2006
14:00
45 Minutes
E1 1
407
Saarbrücken

Abstract

Die Berechnung eines optimalen phylogenetischen Baumes nach der sogenannten Maximum Parsimony Bewertung ist ein gut untersuchtes Problem, das Anwendungen in mehreren wissenschaftlichen Gebieten hat, wie zum Beispiel die Bioinformatik und die Computerlinguistik. Die schnellsten bisher entwickelten Algorithmen für dieses Problem sind Varianten eines Branch-and-Bound Ansatzes, der von Penny and Hendy vor über 20 Jahren entwickelt wurde. In meinem Habilitationsvortrag beschreibe ich einen neuen, wesentlich schnelleren Ansatz,

der auf der Elimination von Teilstrukturen beruht.

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Ernst Althaus
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Ernst Althaus, 07/14/2006 15:49 -- Created document.