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What and Who
Datengestuetzte Modellierung der Dynamik der zellulaeren Signaltransduktion am Beispiel des Epo-Rezeptors
HD Dr. Jens Timmer
Albert-Ludwigs-Universitaet Freiburg
Informatik-Kolloquium
AG 1, AG 2, AG 3, AG 4
Expert Audience
Note: We use this to send email in the morning.
Date, Time and Location
Tuesday, 18 December 2001
14:00
-- Not specified --
45 - FR 6.2
HS 001
Saarbrücken
Abstract
Informationen über biochemische Netzwerke werden in der
Regel rein graphisch in qualitativer und statischer Weise
präsentiert. Am Beispiel der Signaltransduktion des
Epo-Rezeptors wird gezeigt, dass eine quantitative
Beschreibung auch des dynamischen Verhaltens dieser Systeme
möglich ist. Dazu wird die qualitative Darstellung in eine
parametrisierte Differentialgleichung übersetzt. Die
Parameter der Differentialgleichung werden basierend auf
zeitaufgelösten Messungen am System bestimmt. Für den
Epo-Rezeptor wird so gezeigt, dass die bisherige qualitative
Beschreibung nicht hinreichend ist. Es wird ein erweitertes
Modell vorgeschlagen und an empirischen Daten validiert.
Dieses Modell ermöglicht durch in-silico Untersuchungen
Einsichten über das System und die Vorhersage der Ergebnisse
neuer Experimente. Eine Vorhersage bezüglich der
Effektivität der Signaltransduktion in Bezug auf die
Gen-Transkription unter einem gezielten Eingriff in das
System wird empirisch bestätigt.
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