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Event Entry

What and Who

Software-Werkzeuge für die Molekularbiologie

Prof. Dr. Robert Giegerich
Technische Fakultät, Universität Bielefeld
Informatik-Kolloquium
AG 1, AG 2, AG 3, INET, AG 4, AG 5, D6, RG1, SWS  
AG Audience
English

Date, Time and Location

Wednesday, 18 June 97
14:00
60 Minutes
46.1 - MPII
022
Saarbrücken

Abstract

Die aktuellen Fortschritte der Molekularbiologie fuehren zu einer rapide wachsenden Fuelle von Sequenz- und Strukturdaten ueber Gene und Proteine. Damit bietet die Molekularbiologie eine Vielzahl von neuen Herausforderungen fuer die Informatik. Dabei sind verschiedene Arbeitsgebiete der Informatik gefragt (Algorithmik, Visualisierung, Softwaretechnik, Datenbanken,...), insbesondere jedoch die Bereitschaft zu echter Kooperation zwischen Informatikern und Biologen.


Der Vortrag berichtet im ersten Teil ueber verschiedene Entwicklungen, die zum Aufbau eines Bielefelder Bioinformatik-Servers gefuehrt haben.
Der zweite Teil geht naeher auf das Werkzeug RIFLE ein, das der Identifizierung von Mikroorganismen mit genetischen Methoden dient.

Merkmal von RIFLE ist eine perfekte Analogie von Operationen, die einerseits im Labor an konkreten Organismen, und andererseits auf einer Sequenzdatenbank durchgefuehrt werden. Enzymatisch wie algorithmisch werden sogenannte Restriktionsprofile von ribosomaler DNA bestimmt, die dann nach einem dafuer entwickelten Aehnlichkeitsma\3 bewertet werden. Durch Wiederholung dieses Vorgangs unter Verwendung verschiedener Restriktionsenzyme lae\3t sich eine praktisch beliebig hohe Zuverlaessigkeit der Identifizierung erreichen.

Contact

Rosy Fassbender (Lehrstuhl Prof. Dr. Reinhard Wilhelm)
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Der Vortrag richtet sich in erster Linie an Informatiker und setzt keine Kenntnisse aus der Molekularbiologie voraus.

InteressentInnen sind zum Vortrag herzlich eingeladen.