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What and Who

Sequenz, Struktur, Genom: bioinformatische Analyse von RNA und Proteinmolekülen

Dr. med. Thomas Dandekar
Informatik-Kolloquium
AG 1, AG 2, AG 3, AG 4  
Expert Audience

Date, Time and Location

Friday, 26 January 2001
14:00
-- Not specified --
45 - FR 6.1
003
Saarbrücken

Abstract


Das Seminar diskutiert einige der typischen Fragestellungen
und Ergebnisse aus der bioinformatischen Analyse von RNA und
Proteinen an Hand von Beispielen aus der eigenen Arbeit.

- RNA Motifsuchen werden am Beispiel der iron-responsive
elements dargestellt, weitere Programme (z.B. template
free searches) werden kurz andiskutiert.

- Proteinstrukturanalysen werden an Hand von Simulationen
mit genetischen Algorithmen vorgestellt
(Anwendungsbeispiel: Porine aus Amöben).

- Die Analyse von Protein-Netzwerken wird am Beispiel des
Kohlenhydratstoffwechsels von Mycoplasma pneumoniae
vorgestellt. Neben der vergleichenden, differentiellen
Genomanalyse wird hierbei u.a. die
Elementarmodenanalyse genutzt.

Contact

Christian Schulte
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