Das Seminar diskutiert einige der typischen Fragestellungen
und Ergebnisse aus der bioinformatischen Analyse von RNA und
Proteinen an Hand von Beispielen aus der eigenen Arbeit.
- RNA Motifsuchen werden am Beispiel der iron-responsive
elements dargestellt, weitere Programme (z.B. template
free searches) werden kurz andiskutiert.
- Proteinstrukturanalysen werden an Hand von Simulationen
mit genetischen Algorithmen vorgestellt
(Anwendungsbeispiel: Porine aus Amöben).
- Die Analyse von Protein-Netzwerken wird am Beispiel des
Kohlenhydratstoffwechsels von Mycoplasma pneumoniae
vorgestellt. Neben der vergleichenden, differentiellen
Genomanalyse wird hierbei u.a. die
Elementarmodenanalyse genutzt.